超聲波萃取儀作為一種物理手段和工具，能夠在化學反應的介質中產生一系列接近于的條件，這種能量不僅能夠激發或促進許多化學反應、加快化學反應速度，甚至還可以改變某些化學反應的方向。
　　
　　超聲波萃取是利用超聲波輻射壓強產生的強烈空化應效應、機械振動、擾動效應、高的加速度、乳化、擴散、擊碎和攪拌作用等多級效應，增大物質分子運動頻率和速度，增加溶劑穿透力，從而加速目標成分進入溶劑，促進提取的進行。
　　
　　超聲波萃取儀在制藥領域的用途分析：
　　
　　1、加速介質質點運動
　　
　　高于20KHz聲波頻率的超聲波的連續介質（例如水）中傳播時，根據惠更斯波動原理，在其傳播的波陣面上將引起介質質點（包括藥材重要效成分的質點）的運動，使介質質點運動獲行巨大的加速度和動能。質點的加速度經計算一般可達重力加速度的二千倍以上。由于介質質點將超聲波能量作用于藥材中藥效成分質點上而使之獲得巨大的加速度和動能，迅速逸出藥材基體而游離于水中。
　　
　　2、空化作用
　　
　　超聲波在液體介質中傳播產生特殊的“空化效應”，“空化效應”不斷產生無數內部壓力達到上千個大氣壓的微氣穴并不斷“爆破”產生微觀上的強大沖擊波作用在中藥材上，使其中藥材成分物質被“轟擊”逸出，并使得藥材基體被不斷剝蝕，其中不屬于植物結構的藥效成分不斷被分離出來。加速植物有效成份的浸出提取。
　　
　　3、超聲波的振動勻化使樣品介質內各點受到的作用一致，使整個樣品萃取更均勻。
　　
　　綜上所述，中藥材中的藥效物質在超聲波萃取儀的作用下不但作為介質質點獲得自身的巨大加速度和動能，而且通過“空化效應”獲得強大的外力沖擊，所以能高效率并充分分離出來。